Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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