Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm22659-201ENSMUST00000104195 130 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm29725-201ENSMUST00000206614 407 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm38941-201ENSMUST00000208606 529 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm31698-201ENSMUST00000214227 430 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 AC113282.4-201ENSMUST00000225273 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
B230104I21RikQ3USW4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230104I21RikQ3USW4 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230104I21RikQ3USW4 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230104I21RikQ3USW4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230104I21RikQ3USW4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230104I21RikQ3USW4 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230104I21RikQ3USW4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230104I21RikQ3USW4 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230104I21RikQ3USW4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230104I21RikQ3USW4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms