Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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