Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Usp19Q3UJD6 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Usp19Q3UJD6 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Usp19Q3UJD6 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Usp19Q3UJD6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Usp19Q3UJD6 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Usp19Q3UJD6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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