Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms