Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms