Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms