Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlh1Q02576 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms