Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms