Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

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Length 1,118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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RptnP97347 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RptnP97347 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RptnP97347 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RptnP97347 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RptnP97347 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RptnP97347 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RptnP97347 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RptnP97347 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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