Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Aar2-201ENSMUST00000029158 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm45705-201ENSMUST00000211831 2134 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm35288-201ENSMUST00000216565 2731 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rhbdd1-201ENSMUST00000027322 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm42765-202ENSMUST00000200017 3131 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Olfr1221-203ENSMUST00000213404 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Papolg-202ENSMUST00000102863 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Wfs1-202ENSMUST00000166339 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 3930402G23Rik-201ENSMUST00000040608 3086 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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