Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms