Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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