Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Epb42P49222 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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