Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Timp3P39876 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms