Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc1P34928 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms