Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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