Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxraP28700 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxraP28700 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxraP28700 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxraP28700 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxraP28700 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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RxraP28700 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms