Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ggta1P23336 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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