Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TP20293 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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