Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm6467-201ENSMUST00000171547 609 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm37559-201ENSMUST00000193556 832 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ccdc153-206ENSMUST00000216632 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Olfr452-202ENSMUST00000214465 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm11401-201ENSMUST00000117212 344 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm21818-201ENSMUST00000178828 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DmdP11531 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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DmdP11531 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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DmdP11531 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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DmdP11531 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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DmdP11531 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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DmdP11531 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Pm20d1-201ENSMUST00000048660 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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DmdP11531 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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DmdP11531 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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DmdP11531 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms