Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P10404 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P10404 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P10404 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms