Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csf1P07141 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms