Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tgfb1P04202 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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