Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01665 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01665 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01665 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms