Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ccnb1ip1-201ENSMUST00000095932 1509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm13997-201ENSMUST00000155641 336 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 1700061E17Rik-201ENSMUST00000185439 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Nlrp9b-202ENSMUST00000117909 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhx8O35652 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms