Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms