Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm28048F7BCN0 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm28048F7BCN0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28048F7BCN0 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28048F7BCN0 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28048F7BCN0 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28048F7BCN0 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28048F7BCN0 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28048F7BCN0 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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