Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms