Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Clrn2B2RVW2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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