Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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