Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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