Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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