Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Rabgef1Q9JM13 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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