Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chrac1Q9JKP8 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms