Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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