Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms