Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Nop56Q9D6Z1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Nop56Q9D6Z1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Nop56Q9D6Z1 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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