Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lims1Q99JW4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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