Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms