Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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