Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms