Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rdh13Q8CEE7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rdh13Q8CEE7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rdh13Q8CEE7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rdh13Q8CEE7 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rdh13Q8CEE7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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