Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY0

Gatc, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatcQ8CBY0 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GatcQ8CBY0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms