Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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