Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ubash3bQ8BGG7 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ubash3bQ8BGG7 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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