Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms