Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms