Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Tmco5-201ENSMUST00000028834 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms