Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms